植物有令人驚奇的系統來抵禦病蟲害的侵擾。植物能生合成減緩昆蟲攝食的化合物，雖然無法直接殺死昆蟲，但能夠限制昆蟲產生的傷害。而當植物受到傷害，甚至會合成吸引有益昆蟲的物質，能利用有益昆蟲的數量抑制害蟲。
在受到病害侵擾的同時，植物能夠利用防禦系統來保護植物。植物的防禦系統與人類不同，但效果是相似的，一但受到刺激，該系統能防止各種病蟲害的攻擊。植物的抗病系統稱之為「誘導抗性」。植物的抗病基因能夠被外界刺激的訊號激活，訊號能夠到達整個植株，具有性統性。
誘導抗性有兩種主要類型：系統獲得性抗性（SAR）和誘導性系統抗性（ISR）。當植物接觸病原菌會誘導SAR，激素水楊酸和防禦蛋白，保護植物免受各種害蟲的侵害。當植物根系接觸土壤中特定的促進植物生長有益根圈菌（PGPR）時，能誘導ISR，產生激素（茉莉酸和乙烯），以保護植物免受各種害蟲的侵害。
當植物健康時，能夠更好的保護自己免受於外界病蟲害攻擊，且更不容易吸引病蟲害感染，因此健康的土壤與營養均衡的植株能有更強壯的防禦作用。健康的土壤與植株能透過一些方法來實踐：
1. 避免土壤中的氮素過高
2. 補足植物所需的必要元素，如鈣、鉀減緩病害發生
3. 改善土壤壓實，促進根部健康
4. 施用低氮的有機肥，能降低根腐病
5. 刺激土壤為生物多樣性，與壞菌競爭
資料來源：
1. https://www.sare.org/Learning-Center/Books/Building-Soils-for-Better-Crops-3rd-Edition/Text-Version/Soil-Health-Plant-Health-and-Pests/Plant-Defenses-Management-Practices-and-Pests
2. https://www.sare.org/Learning-Center/Books/Building-Soils-for-Better-Crops-3rd-Edition/Text-Version/Soil-Health-Plant-Health-and-Pests/Ecological-Principles-for-Agriculture