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口蹄疫好發在偶蹄類家畜，包括牛、羊、豬、鹿及野生偶蹄類動物身上，此病毒有A、O、C、亞洲一型、南非一型、南非二型及南非三型等7種類型，過去台灣只出現O型，A型是首例，雖然各類型口蹄疫病況類似，但疫苗卻只能針對單一型有保護效果。
以牛隻而言，口蹄疫潛伏期約1至7天，臨床症狀包括：倦怠、流口水、蹄踵、趾間、乳房形成水泡，水泡破裂形成糜爛，病牛舉步唯艱，跛行或倒臥。
至於人類吃了口蹄疫的豬牛羊會怎樣？農委會防檢局表示，由於口蹄疫不是人畜共通傳染疾病，基本上煮熟就沒事，但因為口蹄疫會傳染給所有偶蹄類動物，台灣在1997年（民國86年）爆發嚴重豬隻感染口蹄疫傳染病，這是台灣口蹄疫絕跡68年後再度成為疫區，經濟損失高達1000餘億元，重創台灣養豬產業。
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