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畜牧法規定畜牧場應聘置獸醫師或有特約獸醫師，否則將從十二月起開罰，但南投縣內有五、六百家畜牧場，符合規定的家數不足三成，許多經營規模偏向中小型的農戶抱怨獸醫難覓，徒增開支。縣府農業處表示，九日將邀集各養殖協會及獸醫師公會召開媒合會議，協助農民解決難題。
畜牧法早在民國八十七年通過實施，第九條規定畜牧場應置獸醫師或有特約獸醫師，負責畜牧場之禽畜衛生管理，遇有家畜、家禽發病率達百分之十以上時，獸醫師應於二十四小時內報告當地主管機關，但未能落實，易形成防疫漏洞。
農委會因此要求縣、市政府在十一月底前輔導畜牧場及飼養場，完成獸醫師或特約獸醫師聘任，否則自十二月起將開罰，可處一萬元以上、五萬元以下罰鍰。
縣府農業處農牧防疫科表示，縣內有五、六百家畜牧場或飼養場，初步調查符合畜牧法規定的農戶不到三成，且禽畜種類包括雞、鴨、鵝、豬、羊、牛、鹿等，要全面推動，時間緊迫。
農戶也表示，以縣市養鹿產業為例，農戶平均飼養四十餘頭，規模屬中、小型，許多農戶每年自行為鹿隻注射口蹄疫苗，鹿隻也少有疫情，現在卻要多花錢聘任獸醫師，且執業獸醫師難覓，法令根本窒礙難行。
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